У детей раннего возраста при гормональных нарушениях лечение может состоять из инъекций Testosterone, дозировка и регулярность приема которых устанавливает врач-эндокринолог. Это правильное лечение увеличивает размер полового члена. Когда микропенис вызван тканями полового члена, нечувствительными к тестостерону, гормональное лечение не дает эффекта.

Чем раньше будет обнаружен микропенис, чем быстрее будет назначено лечение, тем более эффективным оно будет. Лечение также может потребоваться в период полового созревания. После полового созревания гормональное лечение перестает быть эффективным, поскольку ткани уже не реагируют таким же образом.

Хирургическое лечение микропениса     

Во взрослом возрасте, когда микропенис не лечился или лечение было недостаточно эффективным, хирургия возможно. Однако это не всегда дает убедительные результаты.

Раздел связки поддерживающий можно предложить часть полового члена, идущую от полового члена к лобку. Он никоим образом не изменяет пенис, а лишь частично отделяет его от лобка, делая его длиннее. Наблюдаемый прирост составляет от 1 до 2 см в вялом состоянии и 1,7 см в эрекции. Это удлинение достигается за счет нестабильности эрегированного полового члена, поскольку он хуже прикреплен к лобку, что может затруднить проникновение.

инъекция собственного жира включает в себя введение жира субъекту под кожу его полового члена. Это никак не удлиняет пенис, но визуально делает его толще. Только часть поставленного жира не усваивается организмом с течением времени (от 10 до 50% в зависимости от субъекта). Резорбция может быть неравномерной и привести к появлению «четок» полового члена.

Микропенис может иметь серьезные психологические последствия, особенно в подростковом возрасте, важно, чтобы человеку оказывали помощь и принимали во внимание его сомнения.